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Enregistrement W2104119798 · doi:10.1095/biolreprod.107.064162

DNA Damage Response During Chromatin Remodeling in Elongating Spermatids of Mice1

2007· article· en· W2104119798 sur OpenAlexaff
Frédéric Leduc, Vincent Maquennehan, Geneviève Bikond Nkoma, Guylain Boissonneault

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCancer therapeutics and mechanisms
Établissements canadiensUniversité de Sherbrooke
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTopoisomeraseDNA supercoilChromatinDNA damageDNA repairDNACell biologyContext (archaeology)Molecular biologyGeneticsDNA replication

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A precise packaging of the paternal genome during spermiogenesis is essential for fertilization and embryogenesis. Most of the nucleosomal DNA supercoiling must be eliminated in elongating spermatids (ES), and transient DNA strand breaks are observed that facilitate the process. Topoisomerases have been considered as ideal candidates for the removal of DNA supercoiling, but their catalytic activity, in the context of such a major chromatin remodeling, entails genetic risks. Using immunofluorescence, we confirmed that topoisomerase II beta (TOP2B) is the type II topoisomerase present in ES between steps 9 and 13. Interestingly, the detection of TOP2B was found coincident with detection of tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1 (TDP1), an enzyme known to resolve topoisomerase-mediated DNA damage. The presence of gamma-H2AX (also known as H2AFX) coincident with DNA strand breakage was also confirmed at these steps and indicates that a DNA damage response is triggered. Active DNA repair in ES was demonstrated using a fluorescent in situ DNA polymerase activity assay on squash preparations of staged tubules. In the context of haploid spermatids, any unresolved double-strand breaks, resulting from a failure in the rejoining process of TOP2B, must likely rely on the error-prone nonhomologous end joining, because homologous recombination cannot proceed in the absence of a sister chromatid. Because this process is part of the normal developmental program of the spermatids, dramatic consequences for the genomic integrity of the developing male gamete may arise should any alteration in the process occur.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,281
Écart entre enseignants0,269 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations159
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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