Identification of HDAC10, a novel class II human histone deacetylase containing a leucine-rich domain
Notice bibliographique
Résumé
Histone acetylation is important for regulating chromatin structure and gene expression. Three classes of mammalian histone deacetylases have been identified. Among class II, there are five known members, namely HDAC4, HDAC5, HDAC6, HDAC7 and HDAC9. Here we describe the identification and characterization of a novel class II member termed HDAC10. It is a 669 residue polypeptide with a bipartite modular structure consisting of an N-terminal Hda1p-related putative deacetylase domain and a C-terminal leucine-rich domain. HDAC10 is widely expressed in adult human tissues and cultured mammalian cells. It is enriched in the cytoplasm and this enrichment is not sensitive to leptomycin B, a specific inhibitor known to block the nuclear export of other class II members. The leucine-rich domain of HDAC10 is responsible for its cytoplasmic enrichment. Recombinant HDAC10 protein possesses histone deacetylase activity, which is sensitive to trichostatin A, a specific inhibitor for known class I and class II histone deacetylases. When tethered to a promoter, HDAC10 is able to repress transcription. Furthermore, HDAC10 interacts with HDAC3 but not with HDAC4 or HDAC6. These results indicate that HDAC10 is a novel class II histone deacetylase possessing a unique leucine-rich domain.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».