Molecular and cytological characterization of 5S rDNA in<i>Oryza</i>species: genomic organization and phylogenetic implications
Notice bibliographique
Résumé
We investigated the molecular characteristics and chromosomal organization of 5S rDNA in the genus Oryza, including diploid and tetraploid species. A phylogenetic tree of Oryza species was constructed based on the non-transcribed spacer sequences of 5S rDNA, and some novel relationships were discovered. Specifically, comparative sequence analysis of 5S rDNA in several wild rice species showed unique characteristics inconsistent with the model of concerted evolution: (1) multiple distinct 5S rDNA types were detected within a species, leading to intraspecific divergence of 5S rDNA; (2) multiple identical 5S rDNA types were shared among species, resulting in interspecies clustering of 5S rDNA types; and (3) intraspecific nucleotide diversity was detected within a 5S rDNA class. Our results obtained by fluorescence in situ hybridization revealed that each rice species studied contained only one 5S rDNA locus with two hybridization sites, which were located on either chromosome 7 or chromosome 11. These results suggest that different 5S rDNA classes within the rice genome were arranged together and that one pair of 5S rDNA loci from a diploid progenitor of the tetraploid species might have been lost during evolution. Taken together, our data show that 5S rDNA in rice species is more informative at the gene level than at the chromosome level.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».