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Enregistrement W2104285849 · doi:10.1007/s10764-013-9705-9

Color Vision Variation as Evidenced by Hybrid L/M Opsin Genes in Wild Populations of Trichromatic Alouatta New World Monkeys

2013· article· en· W2104285849 sur OpenAlexafffund
Yuka Matsushita, Hiroki Oota, Barbara Welker, Mary S. M. Pavelka, Shoji Kawamura

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Primatology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRetinal Development and Disorders
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaState University of New YorkUniversity of CalgaryAmerican Society of PrimatologistsJapan Society for the Promotion of ScienceMinistry of Education, Culture, Sports, Science and TechnologyNational Geographic Society
Mots-clésTrichromacyPhotopigmentBiologyPrimateAnimal ecologyCebidaeOpsinZoologyEvolutionary biologyColor visionGeneticsBotanyEcologyRhodopsin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Platyrrhine (New World) monkeys possess highly polymorphic color vision owing to allelic variation of the single-locus L/M opsin gene on the X chromosome. Most species consist of female trichromats and female and male dichromats. Howlers (genus Alouatta ) are an exception; they are considered to be routinely trichromatic with L and M opsin genes juxtaposed on the X chromosome, as seen in catarrhine primates (Old World monkeys, apes, and humans). Yet it is not known whether trichromacy is invariable in howlers. We examined L/M opsin variation in wild howler populations in Costa Rica and Nicaragua ( Alouatta palliata ) and Belize ( A. pigra ), using fecal DNA. We surveyed exon 5 sequences (containing the diagnostic 277th and 285th residues for λ max ) for 8 and 18 X chromosomes from Alouatta palliata and A. pigra , respectively. The wavelengths of maximal absorption (λ max ) of the reconstituted L and M opsin photopigments were 564 nm and 532 nm, respectively, in both species. We found one M–L hybrid sequence with a recombinant 277/285 haplotype in Alouatta palliata and two L–M hybrid sequences in A . pigra . The λ max values of the reconstituted hybrid photopigments were in the range of 546~554 nm, which should result in trichromat phenotypes comparable to those found in other New World monkey species. Our finding of color vision variation due to high frequencies of L/M hybrid opsin genes in howlers challenges the current view that howlers are routine and uniform trichromats. These results deepen our understanding of the evolutionary significance of color vision polymorphisms and routine trichromacy and emphasize the need for further assessment of opsin gene variation as well as behavioral differences among subtypes of trichromacy.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,012

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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