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Enregistrement W2104315409 · doi:10.1046/j.1529-8817.2003.01162.x

CHARACTERIZATION OF HaRNAV, A SINGLE‐STRANDED RNA VIRUS CAUSING LYSIS OF <i>HETEROSIGMA AKASHIWO</i> (RAPHIDOPHYCEAE)<sup>1</sup>

2003· article· en· W2104315409 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueJournal of Phycology · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueBacteriophages and microbial interactions
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyHeterosigma akashiwoInfectivityVirusVirus-like particleHost (biology)RNAVirologyRNA virusMicrobiologyPhytoplanktonAlgal bloomGeneticsGeneEcology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HaRNAV, a novel virus that infects the toxic bloom‐forming alga Heterosigma akashiwo (Hada) Hada ex Hada et Chihara, was characterized based on morphology, pathology, nucleic acid type, structural proteins, and the range of host strains that it infects. HaRNAV is a 25‐nm single‐stranded RNA (ssRNA) virus with a genome size of approximately 9100 nucleotides. This is the first report of an ssRNA virus that causes lysis of a phytoplankton species. The virus particle is sensitive to chloroform and contains at least five structural proteins ranging in apparent size from 24 to 34 kDa. HaRNAV infection causes swelling of the endoplasmic reticulum and progeny virus particles assemble in the cytoplasm of the host, frequently in crystalline arrays. The infectivity of HaRNAV was tested against 15 strains of H. akashiwo isolated from Japanese waters, the Northeast Pacific, and the Northwest Atlantic. HaRNAV caused lysis of three strains from the Northeast Pacific and two strains from Japan but none from the Northwest Atlantic. The characterization of HaRNAV demonstrates that HaRNAV is a novel type of phytoplankton virus but has some similarities with plant viruses belonging to the Sequiviridae and to other known ssRNA viruses. Further genomic analysis, however, is necessary to determine any phylogenetic relationships. The discovery of HaRNAV emphasizes the diversity of H. akashiwo viral pathogens and, more importantly, algal–virus pathogens and the complexity of virus–host interactions in the environment.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,997

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0040,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle