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Enregistrement W2104338466 · doi:10.1039/c1cp20175a

Effects of external electric fields on double proton transfer kinetics in the formic acid dimer

2011· article· en· W2104338466 sur OpenAlexaff
Alya A. Arabi, Chérif F. Matta

Notice bibliographique

RevuePhysical Chemistry Chemical Physics · 2011
Typearticle
Langueen
DomainePhysics and Astronomy
ThématiqueSpectroscopy and Quantum Chemical Studies
Établissements canadiensMount Saint Vincent UniversityDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryReaction rate constantTransition state theoryElectric fieldDimerProtonDensity functional theoryAtomic physicsWater dimerQuantum tunnellingScanning tunneling microscopeMolecular physicsMoleculeComputational chemistryPhysicsKineticsCondensed matter physicsQuantum mechanics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Molecules can be exposed to strong local electric fields of the order of 10(8)-10(10) V m(-1) in the biological milieu. The effects of such fields on the rate constant (k) of a model reaction, the double-proton transfer reaction in the formic acid dimer (FAD), are investigated. The barrier heights and shapes are calculated in the absence and presence of several static homogenous external fields ranging from 5.14 × 10(8) to 5.14 × 10(9) V m(-1) using density functional theory (DFT/B3LYP) and second order Møller-Plesset perturbation theory (MP2) in conjunction with the 6-311++G(d,p) Pople basis set. Conventional transition state theory (CTST) followed by Wigner tunneling correction is then applied to estimate the rate constants at 25 °C. It is found that electric fields parallel to the long axis of the dimer (the line joining the two carbon atoms) lower the uncorrected barrier height, and hence increase the raw k. These fields also flatten the potential energy surface near the transition state region and, hence, decrease the multiplicative tunneling correction factor. The net result of these two opposing effects is that fields increase k(corrected) by a factor of ca. 3-4 (DFT-MP2, respectively) compared to the field-free k. Field strengths of ∼3 × 10(9) V m(-1) are found to be sufficient to double the tunneling-corrected double proton transfer rate constant at 25 °C. Field strengths of similar orders of magnitudes are encountered in the scanning tunneling microscope (STM), in the microenvironment of a DNA base-pair, in an enzyme active site, and in intense laser radiation fields. It is shown that the net (tunneling corrected) effect of the field on k can be closely fitted to an exponential relationship of the form k = aexp(bE), where a and b are constants and E the electric field strength.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,229 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations148
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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