MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2104413400 · doi:10.1038/msb.2011.34

Economics of membrane occupancy and respiro‐fermentation

2011· article· en· W2104413400 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMolecular Systems Biology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrobial Metabolic Engineering and Bioproduction
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesOntario Ministry of Research and InnovationNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaOffice of ScienceGenome CanadaUniversity of TorontoU.S. Department of Energy
Mots-clésBiologyFermentationBiochemistryOxidative phosphorylationCellular respirationBacteriaRespiratory chainCell biologyBiophysicsMitochondrionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The simultaneous utilization of efficient respiration and inefficient fermentation even in the presence of abundant oxygen is a puzzling phenomenon commonly observed in bacteria, yeasts, and cancer cells. Despite extensive research, the biochemical basis for this phenomenon remains obscure. We hypothesize that the outcome of a competition for membrane space between glucose transporters and respiratory chain (which we refer to as economics of membrane occupancy) proteins influences respiration and fermentation. By incorporating a sole constraint based on this concept in the genome-scale metabolic model of Escherichia coli, we were able to simulate respiro-fermentation. Further analysis of the impact of this constraint revealed differential utilization of the cytochromes and faster glucose uptake under anaerobic conditions than under aerobic conditions. Based on these simulations, we propose that bacterial cells manage the composition of their cytoplasmic membrane to maintain optimal ATP production by switching between oxidative and substrate-level phosphorylation. These results suggest that the membrane occupancy constraint may be a fundamental governing constraint of cellular metabolism and physiology, and establishes a direct link between cell morphology and physiology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,379

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,213
Écart entre enseignants0,200 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle