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Enregistrement W2104559171 · doi:10.1128/aac.48.6.2190-2198.2004

Structure and Association of Human Lactoferrin Peptides with<i>Escherichia coli</i>Lipopolysaccharide

2004· article· en· W2104559171 sur OpenAlexafffund
Daniel S. Chapple, Rohanah Hussain, Christopher L. Joannou, Robert E. W. Hancock, Edward Odell, Robert W. Evans, Giuliano Siligardi

Notice bibliographique

RevueAntimicrobial Agents and Chemotherapy · 2004
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesMedical Research Council Canada
Mots-clésLactoferrinCircular dichroismEscherichia coliLipopolysaccharidePeptideChemistryPolymyxin BBacterial outer membraneBiochemistryBiophysicsBiologyAntibiotics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An 11-amino-acid amphipathic synthetic peptide homologous to a helical region on helix 1 of human lactoferrin HLP-2 exhibited bactericidal activity against Escherichia coli serotype O111, whereas an analogue synthesized with Pro substituted for Met, HLP-6, had greatly reduced antimicrobial activity. The bactericidal activity of HLP-2 was 10-fold greater than that of HLP-6 in both buffer and growth medium by time-kill assays. These assays also showed a pronounced lag phase that was both concentration and time dependent and that was far greater for HLP-2 than for HLP-6. Both peptides, however, were shown to be equally efficient in destabilizing the outer membrane when the hydrophobic probe 1-N-phenylnaphthylamine was used and to have the same lipopolysaccharide (LPS) binding affinity, as shown by polymyxin B displacement. Circular dichroism (CD) spectroscopy was used to study the structure and the organization of the peptides in solution and upon interaction with E. coli LPS. In the presence of LPS, HLP-2 and HLP-6 were found to bind and adopt a beta-strand conformation rather than an alpha-helix, as shown by nonimmobilized ligand interaction assay-CD spectroscopy. Furthermore, this assay was used to show that there is a time-dependent association of peptide that results in an ordered formation of peptide aggregates. The rate of interpeptide association was far greater in HLP-2 LPS than in HLP-6 LPS, which was consistent with the lag phase observed on the killing curves. These results allow us to propose a mechanism by which HLP-2 folds and self-assembles at the outer membrane surface before exerting its activity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,213 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2004
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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