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Enregistrement W2104629500 · doi:10.1139/v07-079

Self-assembly of biomolecules at surfaces characterized by NEXAFS

2007· article· en· W2104629500 sur OpenAlexvenueno aff
Xiaosong Liu, Fan Zheng, Astrid Jürgensen, V. Pérez-Dieste, Dmitri Y. Petrovykh, Nicholas L. Abbott, F. J. Himpsel

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced Biosensing Techniques and Applications
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésXANESBiomoleculeChemistryNucleobaseMonolayerMoleculeNanoscopic scaleCrystallographySelf-assemblyMolecular orbitalSelf-assembled monolayerNanotechnologyDNAChemical physicsSpectroscopyOrganic chemistryMaterials science

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Surface science has made great strides towards tailoring surface properties via self-assembly of nanoscale molecular adsorbates. It is now possible to functionalize surfaces with complex biomolecules such as DNA and proteins. This brief overview shows how NEXAFS (near edge X-ray absorption fine structure spectroscopy) can be used to characterize the assembly of biological molecules at surfaces in atom- and orbital-specific fashion. To illustrate the range of applications, we begin with simple self-assembled monolayers (SAMs), proceed to SAMs with customized terminal groups, and finish with DNA oligonucleotides and Ribonuclease A, a small protein containing 124 amino acids. The N 1s absorption edge is particularly useful for characterizing DNA and proteins because it selectively interrogates the π* orbitals in nucleobases and the peptide bonds in proteins. Information about the orientation of molecular orbitals is obtained from the polarization dependence. Quantitative NEXAFS models explain the polarization dependence in terms of molecular orientation and structure.Key words: NEXAFS, bio-interfaces, ribonuclease A, immobilization, orientation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations19
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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