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Enregistrement W2104658162 · doi:10.1002/bip.21263

Fluorine‐18 labeling of phosphopeptides: A potential approach for the evaluation of phosphopeptide metabolism in vivo

2009· article· en· W2104658162 sur OpenAlexaff
Susan Richter, Ralf Bergmann, Jens Pietzsch, Theres Ramenda, Jörg Steinbach, Frank Wuest

Notice bibliographique

RevueBiopolymers · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiopharmaceutical Chemistry and Applications
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhosphopeptideChemistryPhosphoserineIn vivoPhosphorylationBiochemistryPeptideSerine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Phosphopeptides are very useful reagents to study signal transduction pathways related with cellular protein phosphorylation/dephosphorylation. Phosphopeptides have also been identified as important drug candidates to modulate intracellular signaling mechanisms through targeting phosphotyrosine, phosphoserine, or phosphothreonine residue‐binding protein domains. In this report, we describe the development of a convenient method for the mild and sufficient radiolabeling of phosphopeptides with the short‐lived positron emitter fluorine‐18 (18F) to allow radiopharmacological studies on phosphopeptide metabolism in vivo by means of positron emission tomography (PET). Radiolabeling was accomplished via conjugation of the N‐terminus of polo‐box domain (PBD)‐binding phosphopeptide H‐Met‐Gln‐Ser‐pThr‐Pro‐Leu‐OH with the bifunctional labeling agent N‐succinimidyl‐4‐[18F]fluorobenzoate ([18F]SFB) in reproducible isolated radiochemical yields of 25–28%. Radiopharmacological evaluation in vitro and in vivo of radiolabeled phospheptide [18F]FB‐Met‐Gln‐Ser‐pThr‐Pro‐Leu‐OH [18F]‐3 and its non‐phosphorylated analog [18F]FB‐Met‐Gln‐Ser‐Thr‐Pro‐Leu‐OH [18F]‐4 involved metabolic stability, cell uptake studies, and small animal PET experiments. Radiolabeled phosphopeptide [18F]‐3 showed a remarkable high metabolic stability in vivo compared to the corresponding non‐phosphorylated peptide [18F]‐4. The presented method indicates that radiolabeling of phosphopeptides with [18F]SFB is a promising approach for studying phosphopeptide metabolism in vivo. © 2009 Wiley Periodicals, Inc. Biopolymers (Pept Sci) 92: 479–488, 2009. This article was originally published online as an accepted preprint. The “Published Online” date corresponds to the preprint version. You can request a copy of the preprint by emailing the Biopolymers editorial office at biopolymers@wiley.com

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,060
Tête enseignante GPT0,359
Écart entre enseignants0,299 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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