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Enregistrement W2104794563 · doi:10.1139/b08-033

Reticulate evolution in the parasitic genus<i>Cuscuta</i>(Convolvulaceae): over and over againThis paper is one of a selection of papers published in the Special Issue on Systematics Research.

2008· article· en· W2104794563 sur OpenAlexaffvenue
Saša Stefanović, Mihai Costea

Notice bibliographique

RevueBotany · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Parasitism and Resistance
Établissements canadiensWilfrid Laurier UniversityUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCuscutaBiologyReticulate evolutionSympatric speciationCladeReticulateEvolutionary biologyPhylogenetic treeSubgenusSystematicsGenusParasitic plantBotanyPhylogeneticsParapatric speciationMolecular phylogeneticsZoologyEcologyTaxonomy (biology)Gene flowHost (biology)GeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The frequency and relative importance of hybridization in plants has been an area of intense debate. Although this evolutionary phenomenon has received considerable attention from plant biologists, there are no well-supported cases of reticulate evolution involving parasitic plants, to date. Recent molecular phylogenetic analyses revealed that the subgenus Grammica , the largest and most diverse group of the stem-parasitic genus Cuscuta (dodder), consists of 15 major clades. We describe here five cases of strongly supported discordance between phylogenies derived from plastid and nuclear data, and interpret them as results of five independent hybridization events. Three of these cases could represent relatively recent reticulations, as each of them involves more closely related species, always confined within the same major clade as their putative parental species, and are currently sympatric or parapatric with them. The two remaining cases involve species whose potential progenitors are derived from different major groups of Grammica, and which are allopatric in their present distribution. A series of statistical tests was conducted to assess and further explore the significance of this phylogenetic incongruence. Alternative explanations for discordant gene topologies are explored. Cuscuta liliputana sp. nov., a new Mexican species of hybrid origin is described.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,775
Score d'incertitude au seuil0,601

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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