Aspergillus PCR: One Step Closer to Standardization
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
PCR has been used as an aid in the diagnosis of invasive aspergillosis for almost 2 decades. A lack of standardization has limited both its acceptance as a diagnostic tool and multicenter clinical evaluations, preventing its inclusion in disease-defining criteria. In 2006, the European Aspergillus PCR Initiative was formed. The aim of the initiative was to provide optimal standardized protocols for the widespread clinical evaluation of the Aspergillus PCR to determine its diagnostic role and allow inclusion in disease diagnosis criteria. Quality control panels were developed and circulated to centers for evaluation of the existing methodology before recommendations based on the initial results were proposed for further panels. The centers were anonymously classified as "compliant" or "noncompliant," according to whether they had followed the proposed recommendations before the performance parameters were determined and meta-regression analysis was performed. Most PCR amplification systems provided similar detection thresholds, although positivity was a function of the fungal burden. When PCR amplification was combined with DNA extraction, 50% of the centers failed to achieve the same level of detection. Meta-regression analysis showed positive correlations between sensitivity and extraction protocols incorporating the proposed recommendations and the use of bead beating, white cell lysis buffer, and an internal control PCR. The use of elution volumes above 100 microl showed a negative correlation with sensitivity. The efficiency of the Aspergillus PCR is limited by the extraction procedure and not by PCR amplification. For PCR testing of whole blood, it is essential that large blood volumes (>or=3 ml) be efficiently lysed before bead beating to disrupt the fungal cell and performance of an internal control PCR to exclude false negativity. DNA should be eluted in volumes of <100 microl.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle