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Enregistrement W2104824668 · doi:10.1093/mutage/gei073

Non-transcribed strand repair revealed in quiescent cells

2006· article· en· W2104824668 sur OpenAlex
Jason H. Bielas

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueMutagenesis · 2006
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensYork University
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyDNA repairGeneNucleotide excision repairCarcinogenesisDNA damageMutagenesisT-cell receptorDNAGeneticsCell biologyMolecular biologyMutationT cell

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Stem cells, one of the progenitors of cancer, exist predominately in a quiescent state. Thus, understanding the mechanisms of DNA repair and mutagenesis in such arrested cells may help unravel the complex process of tumorigenesis. Two major nucleotide excision repair (NER) pathways are known to remove bulky physical or chemical lesions from DNA. Transcription-coupled repair (TCR) acts solely on the transcribed strand of expressed genes, while global genomic repair (GGR) is responsible for the ubiquitous repair of the genome. Indirectly, it has been shown that while TCR functions in quiescent cells GGR does not. To explicitly elucidate this phenomenon, we adapted a quantitative PCR (QPCR) assay to study UV-damage repair via TCR and GGR in quiescent and proliferating cells. We present evidence that repair of untranscribed silent regions of the genome and repair of the non-transcribed strand of active genes proceeds by two discrete mechanisms in quiescent cells; rather than by GGR, which was believed to encompass both. Thus, our findings suggest the existence of an alternate NER pathway in quiescent cells. The proposed subcategories of NER are as follows: (i) TCR, responsible for maintenance of transcribed strands; (ii) GGR, responsible for ubiquitous genome repair; and (iii) non-transcribed strand repair (NTSR), predominantly responsible for the repair of the NTS in arrested cells. In quiescent cells, it is evident that TCR and NTSR function and GGR are arrested. As a consequence, mutation accumulation at temporally silent genes and incomplete or imperfect repair of transcribed genes, in quiescent stem cells, may provide a source of cancer causing mutations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,791

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,005
Tête enseignante GPT0,209
Écart entre enseignants0,204 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle