Identification of Ongoing Human Immunodeficiency Virus Type 1 (HIV-1) Replication in Residual Viremia during Recombinant HIV-1 Poxvirus Immunizations in Patients with Clinically Undetectable Viral Loads on Durable Suppressive Highly Active Antiretroviral Therapy
Notice bibliographique
Résumé
In most human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)-infected individuals who achieve viral loads of <50 copies/ml during highly active antiretroviral therapy (HAART), low levels of plasma virus remain detectable for years by ultrasensitive methods. The relative contributions of ongoing virus replication and virus production from HIV-1 reservoirs to persistent low-level viremia during HAART remain controversial. HIV-1 vaccination of HAART-treated individuals provides a model for examining low-level viremia, as immunizations may facilitate virus replication and sequence evolution. In a phase 1 trial of modified vaccinia virus Ankara/fowlpox virus-based HIV-1 vaccines in 20 HIV-infected young adults receiving HAART, we assessed the prevalence of low-level viremia and sequence evolution, using ultrasensitive viral load (<6.5 copies/ml) and genotyping (five-copy sensitivity) assays. Viral evolution, consisting of new drug resistance mutations and novel amino acid changes within a relevant HLA-restricted allele (e.g., methionine, isoleucine, glutamine, or arginine for leucine at position 205 of RT), was found in 1 and 3 of 20 subjects, respectively. Sequence evolution was significantly correlated with levels of viremia of between 6.5 and <50 copies/ml (P = 0.03) and was more likely to occur within epitopes presented by relevant HLA alleles (P < 0.001). These findings suggest that ongoing virus replication contributes to low-level viremia in patients on HAART and that this ongoing replication is subject to CD8(+) T-cell selective pressures.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».