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Enregistrement W2104902103 · doi:10.1186/1471-2407-14-398

A combination of p300 and Braf expression in the diagnosis and prognosis of melanoma

2014· article· en· W2104902103 sur OpenAlexafffund
Madhuri Bhandaru, Gholamreza Safaee Ardekani, Guohong Zhang, Magdalena Martinka, Kevin J. McElwee, Gang Li, Anand Rotte

Notice bibliographique

RevueBMC Cancer · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensSKiN HealthUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanadian Dermatology Foundation
Mots-clésMelanomaVemurafenibMedicineSurgical oncologyOncologyProportional hazards modelNodular melanomaInternal medicineCancer researchMetastatic melanoma

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: To date only a handful of drugs are available for the treatment of melanoma. Among them vemurafenib, a BrafV600E specific inhibitor, showed promising results in terms of response rate and increase in median survival time. However, its effectiveness is limited by development of resistance and the search for additional drugs for melanoma treatment is ongoing. The present study was performed to analyze the correlation between Braf expression and the expression of p300, a known down stream target of the mitogen activated protein kinase (MAPK) pathway, which was recently shown by us to be a prognostic marker for melanoma progression and patient survival. METHODS: The expression of Braf and p300 expression were correlated and analyzed by Chi-square test. A total of 327 melanoma patient cases (193 primary melanoma and 134 metastatic melanoma) were used for the study. Classification & regression tree (CRT), Kaplan-Meier, and multivariate Cox regression analysis were used to elucidate the significance of the combination of Braf and p300 expression in the diagnosis and prognosis of melanoma. RESULTS: Our results demonstrate that Braf expression is inversely correlated with nuclear p300 and positively correlated with cytoplasmic p300 expression. Braf and cytoplasmic p300 were found to be associated with melanoma progression, tumor size and ulceration status. CRT analysis revealed that a combination of Braf and p300 expression (nuclear and cytoplasmic), could be used to distinguish between nevi and melanoma, and primary from metastatic melanoma lesions. The combination of Braf and nuclear p300 was significantly associated with patient survival and nuclear p300 was found to be an independent predictor of patient survival. CONCLUSION: Our results indicate a cross-talk between Braf and p300 in melanoma and demonstrate the importance Braf and p300 expression in the diagnosis and prognosis of melanoma.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,261
Score d'incertitude au seuil0,124

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,240 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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