Incorporating Allee effects in fish stockrecruitment models and applications for determining reference points
Notice bibliographique
Résumé
A new type of stockrecruitment model is examined that incorporates Allee effects, which may occur when fish populations are small. The model is a natural extension of traditional models, which only incorporate the negative effects of increasing density on fecundity and (or) survival. Because the new model is intrinsically nonlinear and because of convergence problems at local optima, we use a maximum likelihood approach with a global genetic search algorithm to estimate model parameters. Parameter uncertainty is obtained from the inverse of the Fisher information matrix. Based on this new model, an extinction probability curve is developed using the parameter defining the Allee effects. This curve can readily be used to calculate the theoretical probability of extinction for a single brood line in one generation for any particular spawner number or biomass. Alternatively, because managers may wish to assign reference points corresponding to particular extinction probabilities, spawner numbers can be determined for these reference points. Two Pacific salmon populations, North Thompson coho (Oncorhynchus kisutch) and Chilko sockeye (O. nerka), are used to demonstrate the approach. It is found that the Allee effect parameter is statistically significant for the Thompson coho, but not for Chilko sockeye.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,012 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,003 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,002 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».