Crystallization and preliminary X-ray crystallographic analysis of p24, a component of the potato nuclear factor PBF-2
Notice bibliographique
Résumé
The Solanum tuberosum (potato) nuclear factor PBF-2 is implicated in pathogen-induced expression of the pathogenesis-related gene PR-10a. Crystals of the DNA-binding component of PBF-2, p24, have been obtained at 277 K in 20 mM Tris-HCl pH 8.0. Recombinant protein with a His tag at its C-terminus was overexpressed in Escherichia coli in the presence and absence of selenomethionine and was purified using a combination of HiTrap affinity columns and gel-filtration chromatography. Crystals suitable for structural analysis were obtained for both native and selenomethionine-labelled proteins and yielded diffraction data at 100 K that were processed to 2.3 and 2.8 A resolution, respectively. The p24 protein crystals belong to space group P2(1)2(1)2(1), with unit-cell parameters a = 69.4 (69.1), b = 89.4 (90.5), c = 144.1 (144.3) A. The asymmetric unit contains four protomers, giving a crystal volume per protein mass (V(M)) of 2.23 A(3) Da(-1) and a solvent content of 45% by volume.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,006 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,002 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».