MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2104957891 · doi:10.1038/aja.2013.13

The diverse heterogeneity of molecular alterations in prostate cancer identified through next-generation sequencing

2013· review· en· W2104957891 sur OpenAlexafffund
Alexander W. Wyatt, Fan Mo, Yuzhuo Wang, Colin C. Collins

Notice bibliographique

RevueAsian Journal of Andrology · 2013
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueProstate Cancer Treatment and Research
Établissements canadiensBC Cancer AgencyUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchProstate Cancer CanadaProstate Cancer Foundation
Mots-clésChromothripsisProstate cancerBiologyContext (archaeology)ChromoplexyTranscriptomeCopy-number variationCancerComputational biologyGenomicsGenetic heterogeneityGenomeGeneticsBioinformaticsGenome instabilityGenePhenotypePCA3Gene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Prostate cancer is a leading cause of global cancer-related death but attempts to improve diagnoses and develop novel therapies have been confounded by significant patient heterogeneity. In recent years, the application of next-generation sequencing to hundreds of prostate tumours has defined novel molecular subtypes and characterized extensive genomic aberration underlying disease initiation and progression. It is now clear that the heterogeneity observed in the clinic is underpinned by a molecular landscape rife with complexity, where genomic rearrangements and rare mutations combine to amplify transcriptomic diversity. This review dissects our current understanding of prostate cancer 'omics', including the sentinel role of copy number variation, the growing spectrum of oncogenic fusion genes, the potential influence of chromothripsis, and breakthroughs in defining mutation-associated subtypes. Increasing evidence suggests that genomic lesions frequently converge on specific cellular functions and signalling pathways, yet recurrent gene aberration appears rare. Therefore, it is critical that we continue to define individual tumour genomes, especially in the context of their expressed transcriptome. Only through improved characterisation of tumour to tumour variability can we advance to an age of precision therapy and personalized oncology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Autre devis · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,990
Score d'incertitude au seuil0,408

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,177
Tête enseignante GPT0,409
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeAutre devis
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations46
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueAsian Journal of AndrologyMême sujetProstate Cancer Treatment and ResearchTravaux en français237 207