RBT1, a novel transcriptional co-activator, binds the second subunit of Replication Protein A
Notice bibliographique
Résumé
Replication Protein A (RPA) is required for DNA recombination, repair and replication in all eukaryotes. RPA participation in these pathways is mediated by single-stranded DNA binding and protein interactions. We herein identify a novel protein, Replication Protein Binding Trans-Activator (RBT1), in a yeast two-hybrid assay employing the second subunit of human RPA (RPA32) as bait. RBT1-RPA32 binding was confirmed by glutathione S:-transferase pull-down and co-immunoprecipitation. Fluorescence microscopy indicates that green fluorescence protein-tagged RBT1 is localized to the nucleus in vivo. RBT1 mRNA expression, determined by semi-quantitative RT-PCR, is significantly higher in cancer cell lines MCF-7, ZR-75, SaOS-2 and H661, compared to the cell lines normal non-immortalized human mammary epithelial cells and normal non-immortalized human bronchial epithelial cells. Further, yeast and mammalian one-hybrid analysis shows that RBT1 is a strong transcriptional co-activator. Interestingly, mammalian transactivation data is indicative of significant variance between cell lines; the GAL4-RBT1 fusion protein has significantly higher transcriptional activity in human cancer cells compared to human normal primary non-immortalized epithelial cells. We propose that RBT1 is a novel transcriptional co-activator that interacts with RPA, and has significantly higher activity in transformed cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».