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Enregistrement W2104985460 · doi:10.1111/j.1365-2982.2012.01990.x

Cytokine gene polymorphisms are associated with irritable bowel syndrome: a systematic review and meta‐analysis

2012· review· en· W2104985460 sur OpenAlexafffund
Mohammad Bashashati, Nima Rezaei, Hossein Bashashati, Arezoo Shafieyoun, N Ebrahimi Daryani, Keith A. Sharkey, Martin Storr

Notice bibliographique

RevueNeurogastroenterology & Motility · 2012
Typereview
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGastrointestinal motility and disorders
Établissements canadiensUniversity of British ColumbiaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésIrritable bowel syndromeMeta-analysisOdds ratioInternal medicineMedicineGenotypeGastroenterologyCytokinePathophysiologyImmunologyGeneGeneticsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Low-grade inflammation has been increasingly implicated in the pathophysiology of irritable bowel syndrome (IBS). Imbalances of pro- and anti-inflammatory cytokines and polymorphisms in cytokine genes have been reported in IBS; however, these findings have not been consistently observed. This may be due to small sample sizes and differences in ethnicities. Therefore, we performed a meta-analysis on the studies that investigated cytokine gene polymorphisms in IBS patients compared to healthy controls. METHODS: A PubMed and EMBASE search was performed, and cytokine gene polymorphisms, which had been investigated in at least two case-control studies, were evaluated. Pooled odds ratios (OR) for the genotypes were calculated using random- or fixed-effects models. KEY RESULTS: Five studies that investigated interleukin-10 (IL-10; -1082 G/A), transforming growth factor-β1 (TGF-β1; +869 T/C and +915 G/C) and tumor necrosis factor (TNF; -308 G/A) polymorphisms in IBS patients and controls were included. High producer IL-10 (-1082 G/G; OR: 0.64 [95% CI: 0.48-0.87]) was significantly associated with a decreased risk of IBS. The intermediate producer TGF-β1 (+915 G/C) genotype showed a tendency toward decreasing the risk of IBS. No associations were found between TNF (-308 G/A) genotypes and IBS in the whole meta-analysis although an analysis of Asian studies revealed an association between TNF (-308 G/A and G/G) genotypes and IBS (OR: 0.50 [95% CI: 0.29-0.85]), and 1.82 [95% CI: 1.08-3.07], respectively). CONCLUSIONS & INFERENCES: This meta-analysis indicates a role for IL-10 polymorphisms in IBS in general and TNF in Asian populations. Whether or not gene polymorphisms are associated with alterations in cytokine levels leading to functional effects at the level of the gut needs further investigation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Méta-épidémiologie (sens large)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,768
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0150,003
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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