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Enregistrement W2105008109 · doi:10.4077/cjp.2009.amh076

Single-Nucleotide Polymorphism of the Exo1 Gene: Association with Gastric Cancer Susceptibility and Interaction with Smoking in Taiwan

2009· article· en· W2105008109 sur OpenAlexaff
Da Tian Bau

Notice bibliographique

RevueThe Chinese Journal of Physiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGenetic factors in colorectal cancer
Établissements canadiensTerry Fox Research Institute
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGenotypeSingle-nucleotide polymorphismAlleleCancerGeneticsInternal medicineOncologyDNA repairBiologyMedicineGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Exonuclease 1 (Exo1) is an important nuclease involved in the mismatch repair system that contributes to the maintenance of genomic stability, modulation of DNA recombination and mediation of cell cycle arrest. Potential polymorphisms in Exo1 may alter cancer risks by influencing the repair activity of Exo1. We hypothesized that single-nucleotide polymorphisms (SNPs) in Exo1 might be associated with risks of gastric cancer. In this hospital-based study, the association of Exo1 A-1419G (rs3754093), C-908G (rs10802996), A238G (rs1776177), C498T (rs1635517), K589E (rs1047840), G670E (rs1776148), C723R (rs1635498), L757P (rs9350) and C3114T (rs851797) polymorphisms with gastric cancer risk in a central Taiwanese population was investigated. In total, 179 patients with gastric cancer and 179 age- and gender-matched healthy controls recruited from the China Medical Hospital in central Taiwan were genotyped. A significantly different distribution was found in the frequency of the Exol K589E genotype, but not the other genotypes, between the gastric cancer and control groups. The A allele Exol K589E conferred a significant (P = 0.0094) increased risk of gastric cancer. Gene-environment interactions with smoking were significant for Exo1 K589E polymorphism, which showed that the Exo1 K589E AG/AA genotype in association with smoking conferred an increased risk of 2.07-fold (95% confidence interval = 1.22-3.50) for gastric cancer. Our results provide the first evidence that the A allele of the Exo1 K589E may be associated with the development of gastric cancer and may be a novel and useful marker for primary prevention and anticancer intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations42
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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