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Enregistrement W2105240147 · doi:10.1186/1740-3391-7-3

Standards of evidence in chronobiology: critical review of a report that restoration of Bmal1 expression in the dorsomedial hypothalamus is sufficient to restore circadian food anticipatory rhythms in Bmal1-/- mice

2009· review· en· W2105240147 sur OpenAlexaff
Ralph E. Mistlberger, Ruud M. Buijs, Étienne Challet, Carolina Escobar, Glenn J. Landry, Andries Kalsbeek, Paul Pévet, Shigenobu Shibata

Notice bibliographique

RevueJournal of Circadian Rhythms · 2009
Typereview
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueCircadian rhythm and melatonin
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChronobiologyCircadian rhythmHypothalamusRhythmWheel runningNeuroscienceBiologyBiological clockLight effects on circadian rhythmPhysiologyMedicineEndocrinologyCircadian clockInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Daily feeding schedules generate food anticipatory rhythms of behavior and physiology that exhibit canonical properties of circadian clock control. The molecular mechanisms and location of food-entrainable circadian oscillators hypothesized to control food anticipatory rhythms are unknown. In 2008, Fuller et al reported that food-entrainable circadian rhythms are absent in mice bearing a null mutation of the circadian clock gene Bmal1 and that these rhythms can be rescued by virally-mediated restoration of Bmal1 expression in the dorsomedial nucleus of the hypothalamus (DMH) but not in the suprachiasmatic nucleus (site of the master light-entrainable circadian pacemaker). These results, taken together with controversial DMH lesion results published by the same laboratory, appear to establish the DMH as the site of a Bmal1-dependent circadian mechanism necessary and sufficient for food anticipatory rhythms. However, careful examination of the manuscript reveals numerous weaknesses in the evidence as presented. These problems are grouped as follows and elaborated in detail: 1. data management issues (apparent misalignments of plotted data), 2. failure of evidence to support the major conclusions, and 3. missing data and methodological details. The Fuller et al results are therefore considered inconclusive, and fail to clarify the role of either the DMH or Bmal1 in the expression of food-entrainable circadian rhythms in rodents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,009
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,014
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Méta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Revue systématique · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,454
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0090,014
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0040,001
Bibliométrie0,0030,003
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,230
Tête enseignante GPT0,411
Écart entre enseignants0,181 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeRevue systématique
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations47
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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