The putative lytic transglycosylase VirB1 from Brucella suis interacts with the type IV secretion system core components VirB8, VirB9 and VirB11
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
VirB1-like proteins are believed to act as lytic transglycosylases, which facilitate the assembly of type IV secretion systems via localized lysis of the peptidoglycan. This paper presents the biochemical analysis of interactions of purified Brucella suis VirB1 with core components of the type IV secretion system. Genes encoding VirB1, VirB8, VirB9, VirB10 and VirB11 were cloned into expression vectors; the affinity-tagged proteins were purified from Escherichia coli, and analyses by gel filtration chromatography showed that they form monomers or homo-multimers. Analysis of protein-protein interactions by affinity precipitation revealed that VirB1 bound to VirB9 and VirB11. The results of bicistron expression experiments followed by gel filtration further supported the VirB1-VirB9 interaction. Peptide array mapping identified regions of VirB1 that interact with VirB8, VirB9 and VirB11 and underscored the importance of the C-terminus, especially for the VirB1-VirB9 interaction. The binding sites were localized on a structure model of VirB1, suggesting that different portions of VirB1 may interact with other VirB proteins during assembly of the type IV secretion machinery.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle