Delayed expansion of a restricted T cell repertoire by low-density TCR ligands
Notice bibliographique
Résumé
The role of TCR ligand density (i.e. the number of antigen-MHC complexes) in modulating the diversity of a T cell response selected from a pool of naive precursors remains largely undefined. By measuring early-activation markers up-regulation and proliferation following stimulation with staphylococcal enterotoxin A (SEA), we demonstrate that decreasing the ligand dose below an optimal concentration leads to the delayed activation of a restricted set of TCRVbeta-bearing T cells, with the specific, non-stochastic exclusion of some TCRVbeta+ T cells from the activated pool. Our results suggest that the failure of these TCRVbeta-bearing T cells to reach the activation threshold at sub-optimal ligand concentration is due to the inefficiency of TCR engagement, as measured by TCR internalization, and does not correlate with the relative precursor frequency in the non-immune repertoire. Moreover, even at SEA concentrations that lead to the simultaneous proliferation of all SEA-reactive T cells, we observe marked differences in the ability to secrete cytokines among the different responsive TCRVbeta-bearing T cells. Altogether, our results indicate that the development of a T cell response to a scarce display of ligand significantly narrows TCR repertoire diversity by mechanisms that involve focusing of the repertoire on the expansion of those T cells with the highest avidity of TCR engagement.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».