Freeze-Thaw Tolerance and Clues to the Winter Survival of a Soil Community
Notice bibliographique
Résumé
Although efforts have been made to sample microorganisms from polar regions and to investigate a few of the properties that facilitate survival at freezing or subzero temperatures, soil communities that overwinter in areas exposed to alternate freezing and thawing caused by Foehn or Chinook winds have been largely overlooked. We designed and constructed a cryocycler to automatically subject soil cultures to alternating freeze-thaw cycles. After 48 freeze-thaw cycles, control Escherichia coli and Pseudomonas chlororaphis isolates were no longer viable. Mixed cultures derived from soil samples collected from a Chinook zone showed that the population complexity and viability were reduced after 48 cycles. However, when bacteria that were still viable after the freeze-thaw treatments were used to obtain selected cultures, these cultures proved to be >1,000-fold more freeze-thaw tolerant than the original consortium. Single-colony isolates obtained from survivors after an additional 48 freeze-thaw cycles were putatively identified by 16S RNA gene fragment sequencing. Five different genera were recognized, and one of the cultures, Chryseobacterium sp. strain C14, inhibited ice recrystallization, a property characteristic of antifreeze proteins that prevents the growth of large, potentially damaging ice crystals at temperatures close to the melting temperature. This strain was also notable since cell-free medium derived from cultures of it appeared to enhance the multiple freeze-thaw survival of another isolate, Enterococcus sp. strain C8. The results of this study and the development of a cryocycler should allow further investigations into the biochemical and soil community adaptations to the rigors of a Chinook environment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».