Genetic variation and coronary atherosclerosis in patients with systemic lupus erythematosus
Notice bibliographique
Résumé
Coronary artery disease is the major cause of mortality in patients with systemic lupus erythematosus (SLE). Increased cardiovascular risk in SLE is not explained by traditional risk factors. We examined the hypothesis that genetic variation contributes to the presence of coronary atherosclerosis in patients with SLE. The genotypes of single-nucleotide polymorphisms (SNP) in 152 candidate genes linked with autoimmune or cardiovascular risk were determined in 125 patients with SLE. Coronary artery calcium (CAC), a measure of coronary atherosclerosis, was detected in 32 patients (26%) by electron-beam computed tomography. Polymorphism in 20 of the candidate genes (ADAM33, ADIPOQ, CCL5, CCR7, CDKN2B, CSF1, IL4, IL12A, IL23R, INS, IRF5, MIF, MS4A1, PTGS1, PTPN22, RETN, SELE, TNFSF4, TNFRSF11B, and VCAM1) were nominally associated with the presence of CAC (p-values = 0.001-0.047 after adjustment for age, sex and race). Some of these are known susceptibility genes for SLE and others have been implicated in cardiovascular disease in other populations. No association withstood false discovery rate adjustment. Replication studies in additional cohorts of patients with SLE may be informative.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».