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Enregistrement W2105369704 · doi:10.1038/ng.2564

GWAS meta-analysis and replication identifies three new susceptibility loci for ovarian cancer

2013· article· en· W2105369704 sur OpenAlexaff
Paul D.P. Pharoah, Ya-Yu Tsai, Susan J. Ramus, Catherine M. Phelan, Ellen L. Goode, Kate Lawrenson, Melissa A. Buckley, Brooke L. Fridley, Jonathan P. Tyrer, Howard C. Shen, Rachel Palmieri Weber, Rod Karevan, Melissa C. Larson, Honglin Song, Daniel C. Tessier, François Bacot, Daniel Vincent, Julie M. Cunningham, Joe Dennis, Ed Dicks, Katja K.H. Aben, Hoda Anton‐Culver, Natalia Antonenkova, Sebastian M. Armasu, Laura Baglietto, Elisa V. Bandera, Matthias W. Beckmann, Michael J. Birrer, Greg Bloom, Natalia Bogdanova, James D. Brenton, Louise A. Brinton, Angela Brooks‐Wilson, Robert Brown, Ralf Bützow, Ian Campbell, Michael E. Carney, Renato S. Carvalho, Jenny Chang‐Claude, Y Anne Chen, Zhihua Chen, Wong‐Ho Chow, Mine Cicek, Gerhard A. Coetzee, Linda S. Cook, Daniel W. Cramer, Cezary Cybulski, Agnieszka Dansonka‐Mieszkowska, Evelyn Despierre, Jennifer A. Doherty, Thilo Dörk, Andreas du Bois, Matthias Dürst, Diana Eccles, Robert P. Edwards, Arif B. Ekici, Peter A. Fasching, David Fenstermacher, James M. Flanagan, Yu-Tang Gao, Montserrat García‐Closas, Aleksandra Gentry‐Maharaj, Graham G. Giles, Anxhela Gjyshi, Martin Gore, Jacek Gronwald, Qi Guo, Mari K. Halle, Philipp Harter, Alexander Hein, Florian Heitz, Peter Hillemanns, Maureen E. Hoatlin, Estrid Høgdall, Claus Høgdall, Satoyo Hosono, Anna Jakubowska, Allan Jensen, Kimberly R. Kalli, Beth Y. Karlan, Linda E. Kelemen, Lambertus A. Kiemeney, Susanne K. Kjær, Gottfried E. Konecny, Camilla Krakstad, Jolanta Kupryjańczyk, Diether Lambrechts, Sandrina Lambrechts, Nhu D. Le, Nathan Lee, Janet Lee, Arto Leminen, Boon Kiong Lim, Jolanta Lissowska, Jan Lubiński, Lene Lundvall, Galina Lurie, Leon F.A.G. Massuger, Keitaro Matsuo, Valerie McGuire, Usha Menon, Francesmary Modugno, Kirsten B. Moysich, Toru Nakanishi, Steven A. Narod, Roberta B. Ness, Heli Nevanlinna, Stefan Nickels, Houtan Noushmehr, Kunle Odunsi, Sara H. Olson, Irene Orlow, James Paul, Tanja Pejović, Liisa M. Pelttari, Jenny Permuth‐Wey, Malcolm C. Pike, Elizabeth M. Poole, Xiaotao Qu, Harvey A. Risch, Lorna Rodríguez-Rodríguez, Mary Anne Rossing, Anja Rudolph, Ingo B. Runnebaum, Iwona K. Rzepecka, Helga B. Salvesen, Ira Schwaab, Gianluca Severi, Hui Shen, Vijayalakshmi Shridhar, Xiao‐Ou Shu, Weiva Sieh, Melissa C. Southey, Paul T. Spellman, Kazuo Tajima, Soo‐Hwang Teo, Kathryn L. Terry, Pamela J. Thompson, Agnieszka Timorek, Shelley S. Tworoger, Anne M. van Altena, David Van Den Berg, Ignace Vergote, Robert A. Vierkant, Allison F. Vitonis, Shan Wang‐Gohrke, Nicolas Wentzensen, Alice S. Whittemore, Elisabeth Wik, Boris Winterhoff, Yin Ling Woo, Anna H. Wu, Hannah Yang, Wei Zheng, Argyrios Ziogas, Famida Zulkifli, Marc T. Goodman, Per Hall, Douglas F. Easton, Celeste Leigh Pearce, Andrew Berchuck, Georgia Chenevix‐Trench, Edwin S. Iversen, Álvaro N.A. Monteiro, Simon A. Gayther, Joellen M. Schildkraut, Thomas A. Sellers

Notice bibliographique

RevueNature Genetics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteMount Sinai HospitalUniversity of TorontoBC Cancer AgencyPublic Health OntarioMcGill University and Génome Québec Innovation CentreMcGill University Health CentreWomen's College HospitalAlberta Health ServicesUniversity of CalgaryMcGill University
Organismes subventionnairesDavid Geffen School of Medicine, University of California, Los AngelesNational Cancer InstituteUniversity Hospital Southampton NHS Foundation TrustAudrey and Theodor Geisel School of Medicine at DartmouthHaukeland UniversitetssjukehusDepartment of Obstetrics, Gynecology and Reproductive Sciences, University of PittsburghDartmouth CollegeDeutsches KrebsforschungszentrumPomorski Uniwersytet Medyczny W SzczecinieRigshospitaletUniversitetet i BergenPeter MacCallum Cancer CentreUniversity of SouthamptonWellcome TrustUniversity of Southern CaliforniaCancer Research UKHerlev HospitalEuropean CommissionMagee-Womens Research InstituteMedizinischen Hochschule HannoverMonash UniversityBrigham and Women's HospitalUniversitätsklinikum JenaUniversity of PittsburghOvarian Cancer Research Fund
Mots-clésBiologyGenome-wide association studyOvarian cancerReplication (statistics)GeneticsComputational biologyMeta-analysisCancerSingle-nucleotide polymorphismInternal medicineVirologyGeneGenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex
Aucun résumé dans les sources couvertes. Son absence est consignée, pas traitée comme un négatif.

Aucun résumé. Ce n'est pas une lacune de cette base de données : OpenAlex n'en a pas non plus. 23,3 % de la base est dans cet état, et le tri y repère MOITIÉ moins de métarecherche ; l'absence est donc un biais mesuré, et non un champ manquant.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,007
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,015
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Méta-analyse · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,038

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0070,015
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,006
Bibliométrie0,0020,003
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,034
Tête enseignante GPT0,322
Écart entre enseignants0,288 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeMéta-analyse
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations361
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentnon

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