Genealogical Relationship among Members of Selection and Production Populations of Yellow Cedar (Callitropsis nootkatensis [D. Don] Oerst.) in the Absence of Parental Information
Notice bibliographique
Résumé
We used DNA fingerprinting and pedigree reconstruction to determine the genetic relationship among members of 3 yellow-cedar (Callitropsis nootkatensis [D. Don] Oerst.) selection populations in the absence of their parental genotypes. Selection population members consisted of the tallest individuals within seedling crops originated from natural stand seed collected from multiple seed donors covering wide areas within 3 distinct locations (phenotypic mass selection). Pairwise relative kinship estimates indicated the presence of extensive coancestry among the selected seedlings, and pedigree reconstruction grouped each selection members into multiple full-sib families of different sizes (1-10) nested within several half-sib families (19-21). The "STRUCTURE" program (Pritchard JK, Stephens M, Donnelly P. 2000. "Inference of population structure using multilocus genotype data." Genetics. 155:945-959.) provided a pictorial classification of the 3 selection populations and grouped their individuals into multiple cohorts (9-10). The STRUCTURE program's results corresponded with that of the pedigree reconstruction, indicating that members of the selection populations originated from a subset of the seed donors forming the natural stand seed collections. The species' silvics, reproductive biology, methods of natural stand seed collection and seedling production, and the high selection intensity applied to form the selection populations contributed to limiting the selection to a subset of the original donor trees. The associated buildup of coancestry in selection and production populations is expected to result in inaccurate estimation of genetic parameters and an unintentional reduction in genetic diversity in reforestation stocks.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».