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Enregistrement W2105503268 · doi:10.1095/biolreprod.106.057430

Activation of an SP Binding Site Is Crucial for the Expression of Claudin 1 in Rat Epididymal Principal Cells1

2007· article· en· W2105503268 sur OpenAlex
Julie Dufresne, Daniel G. Cyr

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiology of Reproduction · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineNeuroscience
ThématiqueBarrier Structure and Function Studies
Établissements canadiensInstitut National de la Recherche Scientifique
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyTransactivationTATA boxMolecular biologyGenePromoterBinding siteClaudinTranscription factorTranscription (linguistics)Gene expressionGeneticsTight junction

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Claudin 1 (CLDN1) is a tight junctional protein present in the epididymis. Limited information exists regarding the regulation of Cldn1 transcription. In the epididymis, the regulation of the 5' flanking region of genes coding for tight junctional proteins is unknown. The present objectives were to investigate the transcriptional regulation of the Cldn1 gene in the rat epididymis. A 1.8-kb sequence of the 5' flanking region of the rat Cldn1 gene was cloned. The transcriptional start site is an adenine located at the -198 position relative to the first codon, and 26 bp downstream of the putative TATA box. It is the only start site for the Cldn1 gene transcription in the rat epididymis. The Cldn1 promoter was inserted into a luciferase gene expression vector and transfected into a rat caput epididymal cell line (RCE-1). Sequential deletion analysis revealed that minimal promoter activity was achieved with the construct containing -61 to +164 bp of the promoter. This sequence contained a TATA box and two consensus SP1 binding sites. Electrophoretic mobility shift and supershift assays confirmed that SP1 and SP3 were present in RCE-1 cells and epididymal nuclear extracts, and that they bind to the 5' SP1 binding motif of the promoter. Site-directed mutagenesis of the 5' SP1 binding site resulted in a 4-fold decrease in transactivation of the minimal promoter sequence. These findings indicate that SP1 and SP3 bind to the Cldn1 promoter region, and that this interaction influences the expression of Cldn1 in the rat epididymis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,212

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,055
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,265 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle