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Enregistrement W2105509059 · doi:10.1136/heartjnl-2011-301156.28

28 Preferential targeting of BNIP3 isoforms to mitochondria and endoplasmic reticulum during metabolic stress

2011· article· en· W2105509059 sur OpenAlexaff
Joseph W. Gordon, Rimpy Dhingra, Lorrie A. Kirshenbaum

Notice bibliographique

RevueHeart · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensUniversity of ManitobaSt. Boniface Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagyEndoplasmic reticulumExonCell biologyRNA splicingGene isoformAlternative splicingMitochondrionBiologyATG16L1Unfolded protein responseProgrammed cell deathMessenger RNAGeneApoptosisBiochemistryRNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alternative gene splicing provides a versatile mechanism by which cells generate proteins with different or even antagonistic properties. Previously we determined the hypoxia-inducible protein Bnip3 is integral component of the mitochondrial death pathway that can signal apoptosis and autophagy but the precise mechanisms that differentially regulates these divergent processes remains cryptic. Herein, we provide novel evidence that inclusion or skipping of exon3 of Bnip3 mRNA by alternative splicing generates proteins with distinct and opposing actions on autophagy and cell survival. Metabolic stress imposed by hypoxia or nutrient deprivation resulted in the synthesis of two Bnip3 mRNA isoforms in post-natal ventricular myocytes in vitro and in vivo. Notably, one Bnip3 mRNA comprised of exons 1 through exon 6 encoded a protein of 26 kDa, while a second mRNA generated by the fusion of exon 2 and exon 4 encoded a truncated Bnip3 protein of 8.2 kDa. Sequence analysis revealed the truncated isoform encodes a conserved C-terminus domain that exclusively targets Bnip3 to the endoplasmic reticulum and not mitochondrion. While the 26 kDa Bnip3 induced mitochondrial perturbations and autophagy, the spliced variant suppressed Bnip3- induced mitochondrial defects and autophagy. Interestingly switching from glucose to fatty metabolism preferentially accumulated the spliced isoform and the association of Bcl-2/Beclin-1 complexes suppressing autophagy. Furthermore, genetic knock-down or mutations within the C- terminus of the spliced variant defective for ER targeting sensitised cardiac myocytes to mitochondrial ROS production and death. To our knowledge our data provide the first direct evidence for a novel survival mechanism whereby the metabolic status of the cell programs autophagy or apoptosis by preferentially targeting Bnip3 isoforms to mitochondria or ER during metabolic stress. Hence, Bnip3Delta ex3 may confer a selective growth advantage that may explain more fundamentally, how certain cells, avert Bnip3 and death during cellular stress.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,448

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,224
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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