The <scp>JR</scp> blood group system: identification of alleles that alter expression
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The ABCG2 gene encodes antigens of the JR blood group system. Red blood cells (RBCs) from individuals homozygous for ABCG2 null alleles are nonreactive with polyclonal and monoclonal anti-Jr(a) . However, some RBCs have been defined as Jr(a+(W) /-) or Jr(a-), particularly when tested with polyclonal anti-Jr(a) . In an effort to resolve these apparent serologic ambiguities, the current study was undertaken. STUDY DESIGN AND METHODS: Hemagglutination of RBCs from two individuals known to express a single copy of functional ABCG2 were compared to RBCs from eight unrelated, previously characterized, Jr(a+(W) /-) donors. Standard polymerase chain reaction-based methods were used to characterize ABCG2 alleles. RESULTS: Two monoclonal anti-Jr(a) clones agglutinated RBCs from the eight Jr(a+(W) /-) study subjects. Two of these subjects were homozygous for a missense ABCG2 change (c.1858A; Asp620Asn). Two were heterozygous for two missense changes; one was c.1858G>A and c.421C>A (Asp620Asn; Gln141Lys), and the other was c.1714A>C and c.421C>A (Ser572Arg; Gln141Lys). The remaining four subjects were heterozygous for c.421C>A (Gln141Lys), and for one of four null alleles. CONCLUSIONS: We have identified three ABCG2 alleles that are newly associated with weakened Jr(a) expression. One of these is novel, the missense allele c.1714A>C (Ser572Arg) and two that have been previously described c.421C>A (rs2231142; Gln141Lys) and c.1858G>A (rs34783571; Asp620Asn). In addition, we found a novel, presumed null allele, c.1017_1019delCTC (Ser340del).
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».