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Enregistrement W2105595131 · doi:10.1093/jac/dkn067

Longitudinal effects of thymidine analogues on mtDNA, mtRNA and multidrug resistance (MDR-1) induction in cultured cells

2008· article· en· W2105595131 sur OpenAlexaffabout
Eszter Papp, Izabella Gadawski, Hélène C. F. Côté

Notice bibliographique

RevueJournal of Antimicrobial Chemotherapy · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS drug development and treatment
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésStavudineZidovudineMitochondrial DNABiologyThymidineReverse-transcriptase inhibitorToxicityReverse transcriptasePharmacologyMolecular biologyMitochondrionImmunologyGeneDNAMedicineGeneticsInternal medicineRNAHuman immunodeficiency virus (HIV)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

OBJECTIVES: HIV nucleoside reverse transcriptase inhibitors (NRTIs) can cause mitochondrial toxicity. In spite of several studies performed on cells, little is known about their long-term effects on mitochondrial DNA (mtDNA), mitochondrial gene expression (mtRNA) and cellular protective mechanisms that such exposure may trigger. Our aim was to investigate the longitudinal effects of two thymidine analogue NRTIs, zidovudine and stavudine, on human cells, measuring their effects on the levels of mtDNA, mtRNA and on induction of the multidrug resistance (MDR) gene MDR-1. METHODS: K562 lymphoblastoid cells were treated for 74 days with zidovudine or stavudine concentrations corresponding to approximately 1x, 20x and 400x those measured in plasma. Samples were collected longitudinally and assayed for mtDNA, mtRNA and MDR-1 mRNA levels by real-time quantitative PCR. mtDNA deletions were investigated by long PCR. RESULTS: Upon exposure to both zidovudine and stavudine, an early dose-dependent and transient increase in mtDNA content was observed. This was followed by a concurrent and transient elevation in both mtRNA and MDR-1 mRNA levels. Interestingly, the increase in mtRNA was most pronounced at low concentrations, whereas that of MDR-1 expression occurred at the highest concentrations only. No mtDNA deletions were detected under any conditions. CONCLUSIONS: Cellular response to thymidine analogue NRTI exposure showed a complex, time- and dose-dependent pattern over time. We report for the first time that NRTIs can induce MDR-1 expression; however, this effect is delayed, possibly in response to oxidative damage or mitochondrial dysfunction. Our results indicate that longitudinal experiments may refine our knowledge about NRTI toxicity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations18
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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