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Enregistrement W2105610784 · doi:10.1139/w2012-100

Possible involvement of the <i>sco2127</i> gene product in glucose repression of actinorhodin production in <i>Streptomyces coelicolor</i>

2012· article· en· W2105610784 sur OpenAlexvenueno aff
Angela Victoria Forero Forero, Mauricio Sánchez‐Silva, Adán Chávez, Beatriz Ruiz‐Villafán, Romina Rodrı́guez-Sanoja, Luis Servín‐González, Sergio Sánchez

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDirección General de Asuntos del Personal Académico, Universidad Nacional Autónoma de México
Mots-clésActinorhodinStreptomyces coelicolorCatabolite repressionMutantComplementationBiologyWild typePsychological repressionBiochemistryGeneMicrobiologyGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Streptomyces coelicolor mutants resistant to 2-deoxyglucose are insensitive to carbon catabolite repression (CCR). Total reversion to CCR sensitivity is observed by mutant complementation with a DNA region harboring both glucose kinase glkA gene and the sco2127 gene. The sco2127 is located upstream of glkA and encodes a putative protein of 20.1 kDa. In S. coelicolor, actinorhodin production is subject to glucose repression. To explore the possible involvement of both SCO2127 and glucose kinase (Glk) in the glucose sensitivity of actinorhodin production, this effect was evaluated in a wild-type S. coelicolor A3(2) M145 strain and a sco2127 null mutant (Δsco2127) derived from this wild-type strain. In comparison with strain M145, actinorhodin production by the mutant was insensitive to glucose repression. Under repressive conditions, only minor differences were observed in glucose utilization and Glk production between these strains. SCO2127 was detected mainly during the first 36 h of fermentation, just before the onset of antibiotic production, and its synthesis was not related to a particular carbon source. The glucose sensitivity of antibiotic production was restored to wild-type phenotype by transformation with an integrative plasmid containing sco2127. Our results support the hypothesis that SCO2127 is a negative regulator of actinorhodin production and suggest that the effect is independent of Glk.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,239
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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