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Enregistrement W2105663561 · doi:10.1111/j.1600-0587.2011.07147.x

Method selection for species distribution modelling: are temporally or spatially independent evaluations necessary?

2011· article· en· W2105663561 sur OpenAlexafffund
David R. Roberts, Andreas Hamann

Notice bibliographique

RevueEcography · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueSpecies Distribution and Climate Change
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésRobustness (evolution)Species distributionContext (archaeology)Environmental niche modellingHabitatModel selectionSelection (genetic algorithm)EcologyPhysical geographyClimate changeComputer scienceStatisticsEnvironmental scienceGeographyMachine learningMathematicsBiologyEcological niche

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To assess the realism of habitat projections in the context of climate change, we conduct independent evaluations of twelve species distribution models, including three novel ecosystem‐based modelling techniques. Habitat hindcasts for 24 western North American tree species were validated against 931 palaeoecological records from 6000, 11000, 14000, 16000 and 21000 yr before present. In addition, we evaluate regional extrapolations based on geographic splits of >55000 sample plots. Receiver operating characteristic analyses indicated excellent predictive accuracy for cross‐validations (median AUC of 0.90) and fair accuracy for independent regional and palaeoecological validations (0.78 and 0.75). Surprisingly, we found little evidence for over‐parameterisation in any method. Also, given high correlations found between model accuracies in non‐independent and independent evaluations, we conclude that non‐independent evaluations are effective model selection tools. Ecosystem‐based modelling approaches performed below average with respect to model sensitivity but excelled in specificity statistics and robustness against extrapolations far beyond training data, suggesting that they are well suited to reconstruct historical biogeographies and glacial refugia.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,241
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,369
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche
Catégories consensuellesMétarecherche
DomaineSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,759
Score d'incertitude au seuil0,936

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2410,369
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,002
Bibliométrie0,0020,002
Études des sciences et des technologies0,0010,002
Communication savante0,0040,004
Science ouverte0,0030,003
Intégrité de la recherche0,0020,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,118
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,191 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; l’étiquette directe de Gemma et le classifieur distillé Codex s’accordent sur ce qui est montré ici.

Devis d'étudeSimulation ou modélisation
DomaineMéthodes
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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