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Correction: Disentangling the Origins of Cultivated Sweet Potato (Ipomoea batatas (L.) Lam.)

2013· article· en· W2105689914 sur OpenAlexaff
Caroline Roullier, Anne Duputié, Paul Wennekes, Laure Benoit, Víctor Manuel Fernández Bringas, Genoveva Rossel, David Tay, Doyle McKey, Vincent Lebot

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiquePacific and Southeast Asian Studies
Établissements canadiensEspace pour la vie
Organismes subventionnairesMinistère de l'Education Nationale, de l'Enseignement Superieur et de la RechercheEuropean Commission
Mots-clésIpomoeaConvolvulaceaeBiologyBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sweet potato (Ipomoea batatas (L.) Lam., Convolvulaceae) counts among the most widely cultivated staple crops worldwide, yet the origins of its domestication remain unclear.This hexaploid species could have had either an autopolyploid origin, from the diploid I. trifida, or an allopolyploid origin, involving genomes of I. trifida and I. triloba.We generated molecular genetic data for a broad sample of cultivated sweet potatoes and its diploid and polyploid wild relatives, for noncoding chloroplast and nuclear ITS sequences, and nuclear SSRs.Our data did not support an allopolyploid origin for I. batatas, nor any contribution of I. triloba in the genome of domesticated sweet potato.I. trifida and I. batatas are closely related although they do not share haplotypes.Our data support an autopolyploid origin of sweet potato from the ancestor it shares with I. trifida, which might be similar to currently observed tetraploid wild Ipomoea accessions.Two I. batatas chloroplast lineages were identified.They show more divergence with each other than either does with I. trifida.We thus propose that cultivated I. batatas have multiple origins, and evolved from at least two distinct autopolyploidization events in polymorphic wild populations of a single progenitor species.Secondary contact between sweet potatoes domesticated in Central America and in South America, from differentiated wild I. batatas populations, would have led to the introgression of chloroplast haplotypes of each lineage into nuclear backgrounds of the other, and to a reduced divergence between nuclear gene pools as compared with chloroplast haplotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,004
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,071
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,104
Score d'incertitude au seuil0,347

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0040,071
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0020,002
Communication savante0,0030,003
Science ouverte0,0040,003
Intégrité de la recherche0,0050,007
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,1040,034

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,047
Tête enseignante GPT0,265
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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