NLRP7 and the genetics of post-molar choriocarcinomas in Senegal
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Gestational choriocarcinomas are malignant tumors of trophoblastic cells that affect 5-25% of women with sporadic hydatidiform moles (HMs) depending on countries and studies. Nucleotide binding and oligomerization domain-like receptor protein 7 (NLRP7) is a major gene responsible for recurrent HMs and recently mutations in this gene have also been shown in 13% of women with sporadic, non-recurrent moles. To investigate the role of NLRP7 in the genetic susceptibility for the malignant degeneration of moles, we sequenced its 11 exons in 43 Senegalese patients with post-molar choriocarcinomas. We report the presence of three novel NLRP7 variants that were found only in patients but not in 100 controls from the Senegalese general population, 100 controls from the Tunisian general population, and 100 controls from the Canadian population. In addition, this analysis revealed significant differences in the frequencies of four non-synonymous NLRP7 variants between European and Senegalese controls with the biggest difference being for variant G487E present at a minor allele frequency of 3.5% in Europeans, 18.1% in Tunisians and 45.6% in Senegalese. Comparing human NLRP7 and its paralog, NLRP2, with their mammalian counterparts revealed that allele E at position 487 is most likely the ancestral allele that was acquired in Africa but driven to low frequencies in Europeans and Asians due to migration, population bottlenecks and selective pressures. This study is the first attempt to investigate the role of NLRP7 in choriocarcinomas and highlights the higher frequencies of NLRP7 variants in the general Senegalese and Tunisian populations both known to have higher frequencies of moles and choriocarcinomas.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle