Palmitoylation by the DHHC protein Pfa4 regulates the ER exit of Chs3
Notice bibliographique
Résumé
The yeast chitin synthase Chs3 provides a well-studied paradigm for polytopic membrane protein trafficking. In this study, high-throughput analysis of the yeast deletion collection identifies a requirement for Pfa4, which is an uncharacterized protein with protein acyl transferase (PAT) homology, in Chs3 transport. PATs, which are the enzymatic mediators of protein palmitoylation, have only recently been discovered, and few substrates have been identified. We find that Chs3 is palmitoylated and that this modification is Pfa4-dependent, indicating that Pfa4 is indeed a PAT. Chs3 palmitoylation is required for ER export, but not for interaction with its dedicated ER chaperone, Chs7. Nonetheless, both palmitoylation and chaperone association are required to prevent the accumulation of Chs3 in high-molecular mass aggregates at the ER. Our data indicate that palmitoylation is necessary for Chs3 to attain an export-competent conformation, and suggest the possibility of a more general role for palmitoylation in the ER quality control of polytopic membrane proteins.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».