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Enregistrement W2105774391 · doi:10.1242/jcs.006221

Lipoamide dehydrogenase mediates retention of coronin-1 on BCG vacuoles, leading to arrest in phagosome maturation

2007· article· en· W2105774391 sur OpenAlexaff
Ala‐Eddine Deghmane, Hafid Soualhine, Horacio Bach, Khalid Sendide, Saotomo Itoh, Andrea Tam, Sanaâ Noubir, Amina Talal, Raymond Lo, Satoshi Toyoshima, Yossef Av‐Gay, Zakaria Hmama

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueTuberculosis Research and Epidemiology
Établissements canadiensSimon Fraser UniversityUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPhagosomePhagolysosomeBiologyMycobacterium smegmatisCell biologyPhagocytosisMicrobiologyMycobacterium tuberculosisTuberculosis

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mycobacterium tuberculosis evades the innate antimicrobial defenses of macrophages by inhibiting the maturation of its phagosome to a bactericidal phagolysosome. Despite intense studies of the mycobacterial phagosome, the mechanism of mycobacterial persistence dependent on prolonged phagosomal retention of the coat protein coronin-1 is still unclear. The present study demonstrated that several mycobacterial proteins traffic intracellularly in M. bovis BCG-infected cells and that one of them, with an apparent subunit size of M(r) 50,000, actively retains coronin-1 on the phagosomal membrane. This protein was initially termed coronin-interacting protein (CIP)50 and was shown to be also expressed by M. tuberculosis but not by the non-pathogenic species M. smegmatis. Cell-free system experiments using a GST-coronin-1 construct showed that binding of CIP50 to coronin-1 required cholesterol. Thereafter, mass spectrometry sequencing identified mycobacterial lipoamide dehydrogenase C (LpdC) as a coronin-1 binding protein. M. smegmatis over-expressing Mtb LpdC protein acquired the capacity to maintain coronin-1 on the phagosomal membrane and this prolonged its survival within the macrophage. Importantly, IFNgamma-induced phagolysosome fusion in cells infected with BCG resulted in the dissociation of the LpdC-coronin-1 complex by a mechanism dependent, at least in part, on IFNgamma-induced LRG-47 expression. These findings provide further support for the relevance of the LpdC-coronin-1 interaction in phagosome maturation arrest.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,031
Tête enseignante GPT0,353
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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