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Enregistrement W2105774885 · doi:10.1186/s12890-015-0041-z

Prevalence and impact of Streptococcus pneumoniae in adult cystic fibrosis patients: a retrospective chart review and capsular serotyping study

2015· article· en· W2105774885 sur OpenAlexafffundabout
Christina S. Thornton, Erin L. Brown, Joenel Alcantara, Harvey Rabin, Michael D. Parkins

Notice bibliographique

RevueBMC Pulmonary Medicine · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiquePneumonia and Respiratory Infections
Établissements canadiensCystic Fibrosis CanadaUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesCystic Fibrosis Canada
Mots-clésMedicineStreptococcus pneumoniaeCystic fibrosisSerotypeCarriagePopulationRespiratory tract infectionsImmunologyInternal medicineMicrobiologyAntibioticsRespiratory systemPathologyBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Cystic fibrosis (CF) is a genetic disease characterized by complex polymicrobial communities within the lower respiratory tract. S. pneumoniae, while a well-defined pathogen in the general population, has rarely been identified in CF. Furthermore, prevalence studies on Pneumococcus in CF have predominantly focused on the infant and pediatric populations, and outcome data is lacking. METHODS: Through a review of our comprehensive clinical and microbiologic database from a single adult CF center in Canada from 1978-2013 we sought to determine the incidence, prevalence, serotype and clinical impact of Pneumococcus in adults with CF. RESULTS: Only fifteen of 318 adult CF patients (5%) were ever found to have transient Pneumococcus colonization, and none developed persistent infection although length of carriage varied. As all isolates were stored, capsular serotyping could be performed using a multiplex PCR panel. Capsular serotyping revealed a varied distribution of several serotypes within these isolates. Lung function testing at time of incident Pneumococcus isolation was compared with values before and after isolation and showed no significant reduction in spirometry values, nor was there an increased need for rescue antibacterial therapy. CONCLUSION: Within our center, incident Pneumococcus infection is neither common, associated with a disproportionate clinical deterioration nor results in chronic infection.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,699

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,313
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2015
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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