A Novel Outer Membrane Protein, Wzi, Is Involved in Surface Assembly of the<i>Escherichia coli</i>K30 Group 1 Capsule
Notice bibliographique
Résumé
Escherichia coli group 1 K antigens form a tightly associated capsule structure on the cell surface. Although the general features of the early steps in capsular polysaccharide biosynthesis have been described, little is known about the later stages that culminate in assembly of a capsular structure on the cell surface. Group 1 capsule biosynthesis gene clusters (cps) in E. coli and Klebsiella pneumoniae include a conserved open reading frame, wzi. The wzi gene is the first of a block of four conserved genes (wzi-wza-wzb-wzc) found in all group 1 K-antigen serotypes. Unlike wza, wzb, and wzc homologs that are found in gene clusters responsible for production of exopolysaccharides (i.e., predominantly cell-free polymer) in a range of bacteria, wzi is found only in systems that assemble capsular polysaccharides. The predicted Wzi protein shows no similarity to any other known proteins in the databases, but computer analysis of Wzi predicted a cleavable signal sequence. Wzi was expressed with a C-terminal hexahistidine tag, purified, and used for the production of specific antibodies that facilitated localization of Wzi to the outer membrane. Circular dichroism spectroscopy indicates that Wzi consists primarily of a beta-barrel structure, and dynamic light scattering studies established that the protein behaves as a monomer in solution. A nonpolar wzi chromosomal mutant retained a mucoid phenotype and remained sensitive to lysis by a K30-specific bacteriophage. However, the mutant showed a significant reduction in cell-bound polymer, with a corresponding increase in cell-free material. Furthermore, examination of the mutant by electron microscopy showed that it lacked a coherent capsule structure. It is proposed that the Wzi protein plays a late role in capsule assembly, perhaps in the process that links high-molecular-weight capsule to the cell surface.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».