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Enregistrement W2105955329 · doi:10.1086/600298

A Possible Cluster of Sexually Transmitted <i>Entamoeba histolytica:</i> Genetic Analysis of a Highly Virulent Strain

2009· article· en· W2105955329 sur OpenAlexaffabout
Irving E. Salit, Krishna Khairnar, Kevin Gough, Dylan R. Pillai

Notice bibliographique

RevueClinical Infectious Diseases · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAmoebic Infections and Treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoUniversity Health NetworkToronto Public HealthToronto General HospitalSt. Michael's Hospital
Organismes subventionnairesLondon School of Hygiene and Tropical Medicine
Mots-clésEntamoeba histolyticaTransmission (telecommunications)MedicineOutbreakGenotypingVirulenceIndex caseFecesContact tracingSexual transmissionVirologyCluster (spacecraft)GenotypeBiologyImmunologyMicrobiologyInternal medicineDiseaseGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Transmission of Entamoeba histolytica generally occurs by fecal excretion of cysts followed by oral ingestion of contaminated food or water. However, fecal-oral transmission may occur within households and long-term care institutions, and sexual transmission occurs among men who have sex with men. Epidemiologically linked clusters of E. histolytica infection are rare in industrialized countries. We report such a sexually linked cluster in Canada. METHODS: An index case involving a young female with an amebic liver abscess led to an epidemiological investigation of sexual contacts. Anti-amebic serological analysis, stool specimen examinations, and abdominal ultrasounds were done for the contacts. Enzyme-linked immunosorbent assay was done for stool antigen specific to E. histolytica. Genotyping and phylogenetic analysis was performed on 1 stool isolate. RESULTS: By tracing sexual contacts related to the index case, we uncovered a cluster of 7 cases of amebiasis (3 with liver abscesses). Oral-anal sex was common in the group; the 5 female individuals were bisexual (4) or homosexual (1). The outbreak strain was genotyped, and cluster analysis indicated that this virulent strain differed substantially from asymptomatic or diarrheal E. histolytica isolates. CONCLUSIONS: E. histolytica can be transmitted by heterosexual activity as well as male and female homosexual activity. Patients with amebiasis should be counselled about possible sexual transmission.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,021
Score d'incertitude au seuil0,742

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,322 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations88
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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