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Enregistrement W2105974856 · doi:10.1002/chem.200702039

Full Structure of the Carbohydrate Chain of the Lipopolysaccharide of <i>Providencia rustigianii</i> O34

2008· article· en· W2105974856 sur OpenAlexaff
Nina A. Kocharova, Anna N. Kondakova, Evgeny Vinogradov, Olga G. Ovchinnikova, Buko Lindner, Alexander S. Shashkov, Antoni Różalski, Yuriy A. Knirel

Notice bibliographique

RevueChemistry - A European Journal · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensInstitute for Biological Sciences
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésChemistryLipid AOligosaccharidePolysaccharideMoietyLipopolysaccharideMonosaccharideMass spectrometryGlycanStereochemistryCarbohydrateElectrospray ionizationBiochemistryHydrolysisChromatographyGlycoproteinBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A lipopolysaccharide isolated from an opportunistic pathogen of the Enterobacteriaceae family Providencia rustigianii O34 was found to be a mixture of R-, SR-, and S-forms consisting of a lipid moiety (lipid A) that bears a core oligosaccharide, a core with one O-polysaccharide repeating unit attached, and a long-chain O-polysaccharide, respectively. The corresponding carbohydrate moieties were released from the lipopolysaccharide by mild acid hydrolysis and studied by sugar and methylation analyses along with one- and two-dimensional NMR spectroscopy and high-resolution electrospray ionization mass spectrometry. As a result, the structures of the core and the O-polysaccharide were established, including the structure of the biological repeating unit (an oligosaccharide that is preassembled and polymerized in biosynthesis of the O-polysaccharide), as well as the mode of the linkage between the O-polysaccharide and the core. Combining the structure of the carbohydrate moiety thus determined and the known structure of lipid A enabled determination of the full lipopolysaccharide structure of P. rustigianii O34.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,179
Écart entre enseignants0,169 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations22
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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