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Enregistrement W2106016783 · doi:10.1164/rccm.200208-964oc

Early Changes in Lung Gene Expression due to High Tidal Volume

2003· article· en· W2106016783 sur OpenAlexaff
Ian B. Copland, Brian P. Kavanagh, Doreen Engelberts, Colin McKerlie, Jaques Belik, Martin Post

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Respiratory and Critical Care Medicine · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRespiratory Support and Mechanisms
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownregulation and upregulationGene expressionHeat shock proteinLungRespiratory epitheliumTidal volumeGeneMedicinePathologyGene expression profilingAndrologyCell biologyMolecular biologyBiologyRespiratory systemInternal medicineGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The purpose of this study was to use gene expression profiling to understand how adult rat lung responds to high tidal volume (HV) ventilation in vivo. HV ventilation for 30 minutes did not cause discernable lung injury (in terms of altered mechanics or histology) but caused obvious injury when continued for 90 minutes. However, at 30-minute ventilation, HV caused significant upregulation of 10 genes and suppression of 12 genes. Among the upregulated genes were transcription factors, stress proteins, and inflammatory mediators; the downregulated genes were exemplified by metabolic regulatory genes. On the basis of cluster analysis, we studied Egr-1, c-Jun, heat shock protein 70, and interleukin (IL)-1beta in further detail. Temporal studies demonstrated that Egr-1 and c-Jun were increased early and before heat shock protein 70 and IL-1beta. Spatial studies using in situ hybridization and laser capture microscopy revealed that all four genes were upregulated primarily in the bronchiolar airway epithelium. Furthermore, at 90 minutes of HV ventilation, a significant increase in intracellular IL-1beta protein was observed. Although there are limitations to gene array methodology, the current data suggest a global hypothesis that (1). the effects of HV are cumulative; (2). specific patterns of gene activation and suppression precede lung injury; and (3). alteration of gene expression after mechanical stretch is pathogenic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,185
Score d'incertitude au seuil0,667

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations153
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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