A <i>Saccharomyces cerevisiae</i> Genome-Wide Mutant Screen for Altered Sensitivity to K1 Killer Toxin
Notice bibliographique
Résumé
Using the set of Saccharomyces cerevisiae mutants individually deleted for 5718 yeast genes, we screened for altered sensitivity to the antifungal protein, K1 killer toxin, that binds to a cell wall beta-glucan receptor and subsequently forms lethal pores in the plasma membrane. Mutations in 268 genes, including 42 in genes of unknown function, had a phenotype, often mild, with 186 showing resistance and 82 hypersensitivity compared to wild type. Only 15 of these genes were previously known to cause a toxin phenotype when mutated. Mutants for 144 genes were analyzed for alkali-soluble beta-glucan levels; 63 showed alterations. Further, mutants for 118 genes with altered toxin sensitivity were screened for SDS, hygromycin B, and calcofluor white sensitivity as indicators of cell surface defects; 88 showed some additional defect. There is a markedly nonrandom functional distribution of the mutants. Many genes affect specific areas of cellular activity, including cell wall glucan and mannoprotein synthesis, secretory pathway trafficking, lipid and sterol biosynthesis, and cell surface signal transduction, and offer new insights into these processes and their integration.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».