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Enregistrement W2106022366 · doi:10.1128/jb.00685-08

Function and Redundancy of the Chaplin Cell Surface Proteins in Aerial Hypha Formation, Rodlet Assembly, and Viability in <i>Streptomyces coelicolor</i>

2008· article· en· W2106022366 sur OpenAlexafffund
Christina Di Berardo, David S. Capstick, Maureen J. Bibb, Kim Findlay, Mark J. Buttner, Marie A. Elliot

Notice bibliographique

RevueJournal of Bacteriology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueMicrobial Natural Products and Biosynthesis
Établissements canadiensMcMaster University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchBiotechnology and Biological Sciences Research CouncilDirectorate for Biological SciencesCanada Research Chairs
Mots-clésStreptomyces coelicolorHyphaBiologyMyceliumMutantMicrobiologyStreptomycesActinomycetalesCell wallBiochemistryBotanyBacteriaGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The chaplins are a family of eight secreted proteins that are critical for raising aerial hyphae in Streptomyces coelicolor. These eight chaplins can be separated into two main groups: the long chaplins (ChpA to -C) and the short chaplins (ChpD to -H). The short chaplins can be further subdivided on the basis of their abilities to form intramolecular disulfide bonds: ChpD, -F, -G, and -H contain two Cys residues, while ChpE has none. A "minimal chaplin strain" containing only chpC, chpE, and chpH was constructed and was found to raise a substantial aerial mycelium. This strain was used to examine the roles of specific chaplins. Within this strain, the Cys-containing ChpH was identified as the major polymerization unit contributing to aerial hypha formation and assembly of an intricate rodlet ultrastructure on the aerial surfaces, and the two Cys residues were determined to be critical for its function. ChpC augmented aerial hypha formation and rodlet assembly, likely by anchoring the short chaplins to the cell surface, while ChpE was essential for the viability of wild-type S. coelicolor. Interestingly, the lethal effects of a chpE null mutation could be suppressed by the loss of the other chaplins, the inactivation of the twin arginine translocation (Tat) secretion pathway, or the loss of the rodlins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,681
Score d'incertitude au seuil0,194

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,220
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations58
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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