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Enregistrement W2106037975 · doi:10.1530/eje-11-0806

Combined expression of BUB1B, DLGAP5, and PINK1 as predictors of poor outcome in adrenocortical tumors: validation in a Brazilian cohort of adult and pediatric patients

2011· article· en· W2106037975 sur OpenAlexaff
Maria Candida Barisson Villares Fragoso, Madson Q. Almeida, Tânia Longo Mazzuco, Beatriz M. P. Mariani, Luciana Pinto Brito, Talita Cardoso Gonçalves, Guilherme Asmar Alencar, Lorena de Oliveira Lima, André M. Faria, Isabelle Bourdeau, Antonio Marmo Lucón, Daniel Soares Freire, Ana Cláudia Latronico, Berenice B. Mendonça, André Lacroix, Antônio Marcondes Lerário

Notice bibliographique

RevueEuropean Journal of Endocrinology · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal and Paraganglionic Tumors
Établissements canadiensCentre Hospitalier de l’Université de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohortPINK1MedicineInternal medicineOncologyCohort studyYoung adultTissue microarrayDiseaseImmunohistochemistryParkin

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: A recent microarray study identified a set of genes whose combined expression patterns were predictive of poor outcome in a cohort of adult adrenocortical tumors (ACTs). The difference between the expression values measured by qRT-PCR of DLGAP5 and PINK1 genes was the best molecular predictor of recurrence and malignancy. Among the adrenocortical carcinomas, the combined expression of BUB1B and PINK1 genes was the most reliable predictor of overall survival. The prognostic and molecular heterogeneity of ACTs raises the need to study the applicability of these molecular markers in other cohorts. OBJECTIVE: To validate the combined expression of BUB1B, DLGAP5, and PINK1 as outcome predictor in ACTs from a Brazilian cohort of adult and pediatric patients. PATIENTS AND METHODS: BUB1B, DLGAP5, and PINK1 expression was assessed by quantitative PCR in 53 ACTs from 52 patients - 24 pediatric and 28 adults (one pediatric patient presented a bilateral asynchronous ACT). RESULTS: DLGAP5-PINK1 and BUB1B-PINK1 were strong predictors of disease-free survival and overall survival, respectively, among adult patients with ACT. In the pediatric cohort, these molecular predictors were only marginally associated with disease-free survival but not with overall survival. CONCLUSION: This study confirms the prognostic value of the combined expression of BUB1B, DLGAP5, and PINK1 genes in a Brazilian group of adult ACTs. Among pediatric ACTs, other molecular predictors of outcome are required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,018

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,252
Écart entre enseignants0,235 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations91
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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