Activation of Interferon Regulatory Factor 5 by Site Specific Phosphorylation
Notice bibliographique
Résumé
The cellular defense to infection depends on accurate activation of transcription factors and expression of select innate immunity genes. Interferon regulatory factor 5 (IRF5), a risk factor for systemic lupus erythematosus, is activated in response to pathogen recognition receptor engagement and downstream effector molecules. We find the nucleotide-binding oligomerization domain containing protein 2 (NOD2) receptor to be a significant activator of IRF5. Phosphorylation is key to the regulation of IRF5, but the precise phosphorylation sites in IRF5 remained to be identified. We used mass spectrometry to identify for the first time specific residues that are phosphorylated in response to TANK-binding kinase-1 (TBK-1), tumor necrosis factor receptor-associated factor 6 (TRAF6), or receptor interacting protein 2 (RIP2). RIP2, a kinase known to function downstream of NOD2, was the most effective activator of IRF5-regulated gene expression. To determine if the phosphorylated residues are required or sufficient for IRF5 activity, aspartic acid phosphomimetic substitutions or inactivating alanine substitutions were tested. Phosphorylation of carboxyl serines 451 and 462 appear the primary trigger of IRF5 function in nuclear accumulation, transcription, and apoptosis. Results indicate polyubiquitination of IRF5 does not play a major role in its transcriptional activity, and that ubiquitination and phosphorylation are independent modifications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».