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Enregistrement W2106162972 · doi:10.3732/ajb.92.1.63

Trans‐species shared polymorphisms at orthologous nuclear gene loci among distant species in the conifer <i>Picea</i> (Pinaceae): implications for the long‐term maintenance of genetic diversity in trees

2005· article· en· W2106162972 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueAmerican Journal of Botany · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensUniversité LavalGDG Environnement
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyNuclear geneOutcrossingPopulationMonophylyEvolutionary biologyCoalescent theoryGeneticsEcologyPhylogeneticsMitochondrial DNAGeneCladePollen

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

For each of three nuclear gene loci, intraspecific- as well as trans-specific shared polymorphisms were detected in DNA among three distantly related species in the genus Picea. Few fixed interspecific polymorphisms were observed. Allele genealogies did not match species phylogenies, and species lineages were not reciprocally monophyletic. Based on molecular clocks and morphological evidence from the fossil record, the divergence time between species was estimated at 13-20 million years (my), and a mutation rate of 2.23 × 10(-10) to 3.42 × 10(-10) per site per year was estimated. Large historical population sizes in excess of 100 000 were inferred, which would have delayed the fixation of polymorphisms. These numbers translated into allele coalescence times in the order of 10 to 18 my, which implies the sharing of polymorphisms since common ancestry. These results suggest that trans-species shared polymorphisms might be frequent at plant nuclear gene loci, leading to high allelic diversity. Such a trend is more likely in trees and plants characterized by ecological and life-history determinants favoring large population sizes such as an outcrossing mating system, wind pollination, and a dominant position in ecosystem. These polymorphisms also call for caution in estimating congeneric species phylogenies from nuclear gene sequences in such plant groups.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,097
Score d'incertitude au seuil0,335

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle