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Enregistrement W2106195012 · doi:10.4049/jimmunol.0900441

The Adaptor Protein p62/SQSTM1 Targets Invading Bacteria to the Autophagy Pathway

2009· article· en· W2106195012 sur OpenAlexaff
Yiyu T. Zheng, Shahab Shahnazari, Andreas Brech, Trond Lamark, Terje Johansen, John H. Brumell

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Immunology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAutophagy in Disease and Therapy
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenToronto Rehabilitation InstituteUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAutophagySignal transducing adaptor proteinCell biologyUbiquitinBiologyIntracellular parasiteBAG3Innate immune systemCytosolIntracellularSignal transductionBiochemistryReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Autophagy, a cellular degradative pathway, plays a key role in protecting the cytosol from bacterial colonization, but the mechanisms of bacterial recognition by this pathway are unclear. Autophagy is also known to degrade cargo tagged by ubiquitinated proteins, including aggregates of misfolded proteins, and peroxisomes. Autophagy of ubiquitinated cargo requires p62 (also known as SQSTM1), an adaptor protein with multiple protein-protein interaction domains, including a ubiquitin-associated (UBA) domain for ubiquitinated cargo binding and an LC3 interaction region (LIR) for binding the autophagy protein LC3. Previous studies demonstrated that the intracellular bacterial pathogen Salmonella typhimurium is targeted by autophagy during infection of host cells. Here we show that p62 is recruited to S. typhimurium targeted by autophagy, and that the recruitment of p62 is associated with ubiquitinated proteins localized to the bacteria. Expression of p62 is required for efficient autophagy of bacteria, as well as restriction of their intracellular replication. Our studies demonstrate that the surveillance of misfolded proteins and bacteria occurs via a conserved pathway, and they reveal a novel function for p62 in innate immunity.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations568
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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