Carboxyethylarginine Synthase Genes Show Complex Cross-Regulation in Streptomyces clavuligerus
Notice bibliographique
Résumé
Carboxyethylarginine synthase is the first dedicated enzyme of clavam biosynthesis in Streptomyces clavuligerus and is present in two isoforms encoded by two separate genes. When grown on a liquid soy medium, strains with ceaS1 deleted showed only a mild reduction of clavam biosynthesis, while disruption of ceaS2 abolished all clavam biosynthesis. Creation of an in-frame ceaS2 deletion mutant to avoid polarity did not restore clavam production, nor did creation of a site-directed mutant altered only in a single amino acid residue important for activity. Reverse transcriptase PCR analyses of these mutants indicated that the failure to produce clavam metabolites could be traced to reduced or abolished transcription of ceaS1 in the ceaS2 mutants, despite the location of ceaS1 on a replicon completely separate from that of ceaS2. Western analyses further showed that the CeaS1 protein (as well as the CeaS2 protein) was absent from the ceaS2 mutants. Complementation experiments were able to restore clavam production partially, but only by virtue of restoring CeaS2 production. CeaS1 was still absent from the complemented strains. While this dependence of CeaS1 production on the expression of ceaS2 from its native chromosomal location was seen in all of the ceaS2 mutants, the effect was limited to growth in liquid medium. When the same mutants were grown on solid soy medium, clavam production was restored and CeaS1 was produced, albeit at low levels compared to the wild type.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».